Jesen neizogibno prihaja. Pri obiranju pridelkov na parceli ali na vrtu lahko opazimo sadje in zelenjavo, ki jo okužijo bakterije in glive. Tako poškodovane pridelke pogosto kompostiramo, da se lahko razgradijo in dajo dragocene organske snovi. Vendar je treba razmisliti, ali tako pripravljen kompost v prihodnosti ne bo ogrozil zdravja naših rastlin.
Če nabrana korenovka kaže simptome ti mehka (mokra) gniloba, tkivo je vodeno, vlažno, se na dotik drobi in spremlja neprijeten vonj, bolje je, da ga ne kompostiramo. To so lahko znaki bakterijske bolezni. Bakterija mokre gnilobe lahko v tleh preživi približno 5-7 let.
Tudi bakterije, ki povzročajo kotne madeže na listih kumar, lahko preživijo več let. Simptom te bolezni so sprva bež, vodne lise na listih, ki se sčasoma izsušijo in luščijo, listi pa ostanejo značilni,
z nepravilno obliko luknje. Simptomi te bolezni se pojavijo tudi na plodovih, ki gnijejo. Spet se je treba izogibati kompostiranju okuženih listov in kumar. Obstaja še veliko drugih bolezni, ki lahko v kompostu preživijo do nekaj let. Najboljši način za uporabo rastlinskih organov, okuženih z bakterijami in glivicami, je, da jih zažgemo ali vržemo v komunalne smeti.
Za kompost ni vse primerno
Pogosto v kompost damo tudi plevel, ki ga odstranimo s postelj, vendar pod enim pogojem - plevel ne sme biti v fazi cvetenja, ker lahko na ta način v kompost vnesemo semena, ki se bodo v prihodnosti vrnila na naša trdno negovana ležišča.